由于医药公司运输药品方式普遍是小批量、多批次，所以很难使冷藏品的集运具有规模效应，物流公司想要解决这个问题很困难。北京市药监局曾对北京市营业额在2亿元以上的药品批发企业拥有的运输设备情况进行调研，数据显示，28家营业额2亿元以上的药品批发企业，平均每家拥有运输车辆的数量仅为1.28辆。而在不发达的三、四线城市，物流市场更为落后，具备冷藏品运输条件的设施设备更少、此外，大型医药冷链物流企业数量过少，制度化水平不高，在药品冷藏、运输、分捡、包装等方面效率不高。冷藏药品的全程冷链是一个必然要求，可是由于管理机制等原因，许多需冷藏的药品从出厂一直到患者使用的整个链条上，常常出现“断链”现象。

　　第三方冷链物流“多、小、散、乱”。除了制药企业发运以外，大量冷藏品在商业环节缺乏有效的冷链运输条件。许多企业托运冷藏品，过程中一旦涉及到多家物流公司之间分别作业，药品在托运终端就很难再保证冷藏运输条件。尤其是在冷藏品退货环节，即逆向物流阶段，冷藏条件几乎完全丧失，这可能带来严重的药品质量问题。国内迄今尚无专业从事冷藏药品冷链物流的、具有覆盖全国市场配送能力的专业化冷链物流企业。一般有实力的大型药品流通企业能保证药品质量，一些小的物流公司缺乏药品冷链运输的意识，再加上成本因素的影响，难以保障冷链运输，尤其当药品送到二三线城市或者偏远地区，就存在安全隐患。，引发行业强烈关注，但取消是否意味着全面放开，，具体工作实施，后续还期待具体细则出台。

　　医药供应链应该是一个闭环的生态链，但受技术条件限制，我国医药冷链物流从供应链顶层到底层涉及医药制造商、供应商、分销商、零售商等物流节点，没有实现完全联网，各环节采用各自独立的管理方式，无法实现各环节相互之间各种因素的继承与组织协调，难以实现信息共享，也就难以对全程冷链的药品及环境等信息进行跟踪、预警和追溯。此外，多数物流公司采用在出货和进货时进行温度测定，这种人工确认温度的方法难以实现温控数据的连续性和准确性。更关键的是，药企配送冷藏品，药监部门如何使用科技手段对其进行有效的跟踪，目前并无定论。看似这些行为属于企业自主经营行为，但是正是因为无标准可依，反而导致目前药企冷链物流管理的混乱，为人民用药安全带来了隐患。

　　目前冷链物流人才匮乏已成为制约我国医药冷链物流行业快速发展的瓶颈。近年来我国物流产业蓬勃发展，企业对物流人才的需求量也逐年增加，但与之相应的物流人才教育却跟不上产业发展的步伐，既懂物流又懂医药的人才偏少，全国各地医药物流人才缺口很大，至于物流领域的新兴产业——药品冷链物流，人才缺口则更加严重。